在可见的未来,人类偶然发现了被喻为之谜的“盖塔射线”,但是无人知道,那将会是世界末日的开始……由于INVADER突然来袭,月球在转眼之间被占领,跟着,它们的魔爪企图伸展到地球。人类用高科技的结晶——“超级机器人”,经过长达十年的“月世界战争”,成功把可怕的侵略者消灭了,但是…… 早乙女博士以未开发成功的『三一万能侠』迎击反被击溃!一方面博士着手开发『新·三一万能侠』;另一方面,认为必须找到3位合适的驾驶员....。和平年代,继承了假面超人月骑衣钵的少年红渡进入森罗高中,开始了磕磕绊绊的校园生活。某天,一名仓皇落魄的越狱犯闯入高中,此人名叫杉村隆,是一个历经22年岁月未见衰老的奇怪之人。一阵混乱过后,杉村隆被觉醒的传说偶兽带走。从白峰天斗的口中得知,杉村不老的秘密极可能和22年前其亲手策划的劫持女子音乐家的事件有关,而这一切导致了最为恐怖的上古魔王传说偶兽复活。
为了粉碎传说偶兽的阴谋,红渡穿越时空回到了1986年,并且见到了自己的父亲红音也。他与父亲试图改变历史,然而一切依旧朝着最糟糕的事态发展……。现代忍者的故事。。