故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗,他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师·黒羽盗一。某日,他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服,于是他打算会见基德。在那里,他遇到了父亲过去的同伴·寺井,并得知父亲就是怪盗基德,而且死因不是事故死而是他杀。于是,快斗为查出杀害父亲的犯人,而自己成为了基德。
本作和《名侦探柯南》有不少共通点。例如怪盗基德在两作中均有出现、迷之组织的登场、主人公真正身份不被世人所知,等等,感觉就像是融合了魔法元素的柯南。。青井和哉(市来光弘 配音)是一个善良平凡的少年,姐姐青井和叶(能登麻美子 配音)的死却永远的改变了他将来的道路。袭击和叶的,是一种名叫“NOVA”的异次元体,为了替姐姐报仇,和哉进入了培养与异次元体战斗的战士的专门学校——杰尼提克斯学院。
在学院中,学员们被分为潘多拉与制御者两种类别,就这样,和哉结识了一群外表柔弱实力却异常强大的女孩子们。其中,被称为最强潘多拉的莎缇莱萨(能登麻美子 配音)最让和哉感到在意,在机缘巧合之下,和哉竟然和她结成了搭档。此外,还有外刚内柔的傲娇娘嘉涅沙(喜多村英梨 配音),神秘的西藏转学生拉娜林沁(花泽香菜 配音)等人。在战斗和学习的过程中,和哉下定决心,一定要揭开姐姐死亡的谜团。。胡雪姬是一只狐精,受狐母九尾琵琶精的庇护,亦为她卖命。卫十郎出生在以贩卖狐裘为生的家族之中,是狐母的眼中钉肉中刺。狐母派遣胡雪姬前去诱惑并杀掉卫十郎,报仇雪恨,在此过程中,胡雪姬却被卫十郎的真诚和善良所打动,情不自禁的爱上了他。
猎王的好友丧命于狐妖之手,临死前将遗恨托付给了猎王,带着朋友的遗愿,猎王与狐妖势不两立。某日,他遇见了卫十郎,想要收他为徒,两人共同对付胡雪姬,哪知道卫十郎早已经和胡雪姬两情相悦,那边厢,胡雪姬因为没能够完成任务而遭到了狐母的惩罚,她该如何取得猎王的信任,证明自己的清白呢?。