富士山南麓的名琅莊是伯爵古館種人的鄉間別墅,一向以貴族的奢侈生活、諸多美女粉黛和神秘的地道而遠近聞名。二十年前,古館種人的兒子一人伯爵及妻子加奈子在這裏雙雙暴死;二十年後,他的兒子辰人又死在祖父留下的豪華馬車上,隨後慘案接二連三地在名琅莊發生了,連一向機智過人的大偵探金田一耕助也如墜入雲裏霧中…。在六年级的时候,他和他的朋友们一起讲述了这个有名无实的主人公的冒险经历。。港口城市海昌,是一个以海洋科技为先导迅速发展起来的新兴沿海城市,这里不但是我国走向海洋的前沿阵地,也是境外间谍组织密切关注的焦点……
海昌市国家安全局一名侦查员在执行任务时失踪,引起了省厅高度重视,李厅长指派经验丰富的武梅率专案组赴海昌追查事件真相:敌我双方的较量随即在出海测试的“探索一号”工作船上展开……
不久,一艘渔船在“探索一号”工作船的测试海域意外打捞起一个神秘的海底装置——“水母”。深海研究员立即组成以副总工程师岳诚为首的科研小组,对该装置进行破解。境外间谍组织头目彼得森获悉“水母”丢失后,紧急责令潜伏海昌多年的海洋俱乐部总经理王维韬,不惜一切代价夺回“水母”芯片。
专案组在挫败了间谍组织的一系列行动,抓获海昌间谍组织骨干王维韬,但武梅发现事件背后隐藏着一个更加令人震惊的阴谋——水母计划,境外间谍组织已将多枚“水母”投放到我国海域,目的是窃取我国海洋信息环境与资源信息,而执行“水母计划”的“钓鱼者”身份神秘……。