故事的舞台是离今稍微远点的未来。
世界上正流行这一种感染后在60天之内就会石化,死亡率高达100%的奇病“美杜莎”。为了在未来寻求这种在全世界爆发的不治之症的治疗方法,于是决定将Cold sleep(冷冻睡眠,简称CS,是指将人体保存在低温状态让人保持沉睡的状态,防止人的身体随着时间老化的一种方法。多见于SF作品之中。)投入使用了。少女霞从众多的人中脱颖而出成为了世界上仅有的160个拥有CS资格的人。他们在苏格兰的古城中制造出来的Cold sleep capsule center(冷冻睡眠胶囊中心,简称CSCC,如字面上的意思进行冷冻睡眠的地方。)中进入了不知道何时才会醒来的长眠。霞想着肯定再也无法与和自己同样感染了“美杜莎”却没有被选上的双胞胎姐姐见面了,眼泪不禁的流落了下来。
但是寻求未来的长眠却被突然中断了。出现在觉醒后的霞面前的是已经面目全非的冷冻胶囊中心。宛如童话《睡美人》中的城堡一样,整个中心都被蔷薇覆盖着。但是现状却不那么美好,异形的怪物们袭击了过来,资格者们不断的死去。为什么会有怪物?那之后究竟过了多少年?几十年?几百年?外界的情况又怎么样了呢?美杜莎的治疗方法呢?在所有情报都被遮断的极限状况下,为了生存下去霞等7个资格者开始逃离中心了。。一名年迈的圣佩德罗歹徒试图与他的孩子们重新联系,并纠正他过去的错误,但犯罪的黑社会不会自愿放松他们的控制。。公元794年,日本桓武天皇时期,京都长冈被其胞弟早良亲王怨灵诅咒,天灾人祸不断。桓武天皇被迫迁都平安京,由此开启四百年平安时代序幕。彼时权贵内部斗争激烈,人民生活疾苦,世间因此怨灵丛生,人、鬼与怪物屏息同栖。隶属于宫廷阴阳寮的阴阳师们,作为平衡天、地、人、鬼间矛盾的存在,自此活跃在历史舞台上,其中最为耀眼的便是身世成谜的安倍晴明(野村万斋 饰)。右近卫中将源博雅(伊藤英明 饰)受托拜访安倍晴明,被所目睹的奇异景象及晴明的个人魅力深深折服;晴明亦被博雅正直的品德吸引。故事便从两人宿命相识,结下珍贵情谊开始。
宫廷内近来异事频发。左大臣藤原师辅之女诞下敦平亲王,婴儿降世却身负诅咒。晴明招来蜜虫(今井绘理子 饰)和神秘女子青音(小泉今日子 饰),与博雅一同化解恶咒,却反遭诬陷。原来一切皆是阴阳头道尊(真田广之 饰)所为。他利用左右大臣间矛盾与后妃间争宠频生事端,更欲召唤出150年前的最强怨灵早良亲王,将平安京彻底颠覆……
影片根据梦枕貘《阴阳师》系列小说改编。。