电影"南山的部长们"以韩国中央情报部(KCIA)的部长们(副总理级)与他们所主导的政治阴谋为素材, 原作为揭露韩国政治内幕的同名小说,以历代中央情报部的部长金载圭和金炯旭的故事为中心重新创作而成。1979年下半年,YH贸易女工笼城事件、新民党总裁金泳三的国会议员除名事件以及10月的釜马事件先后爆发,政局不定。中央情报部金载圭和强硬派总统警卫室室长发生摩擦,朴正熙对他逐渐反感和不信任。1979年10月26日,在汉城钟路区宫井洞中央情报部官邸中,朴正熙和总统警卫室室长在宴会酒席中被金载圭用手枪枪杀。。风雨交加的夜晚,一场盛大的婚礼正在某豪华星级酒店举行时,突发骇人听闻惨案,伴娘子清(李心洁)成为唯一目击证人。在警署,子清一口咬定疑凶是闭路电视上的神秘人孙玲(林嘉欣)。得知孙玲与自己的男友有着不同寻常的隐情后,因肾脏有问题一直觉得亏欠男友的子清几乎崩溃。
子清受到凶徒袭击,幸得孙玲及时出手救援才捡回一命。与孙玲相处时,子清渐生宽恕和感激之心。就在两人的友谊日渐成熟之时,一直逍遥在外的真凶开始向她们逼近。。