新的一年,明修学苑理事长樱井凉子(黑木瞳 饰)带领麾下精英开赴湘南,宣布合并后的明修湘南高中的成立。内山田广志(田山凉成 饰)任副校长,而鬼冢英吉(AKIRA 饰)则担任2年A班的副班主任。与此同时,弹间龙二(城田优 饰)和冴岛俊行(山本裕典 饰)也因各种原因回到故乡,曾经大闹湘南的坏小孩们重聚湘南。鬼冢与高傲的女教师藤川穗奈美(比嘉爱未 饰)共同打理2年A班,宫地明里(三吉彩花 饰)、宇佐美太一(佐野玲于 饰)、芹泽航平(龙星凉 饰),一个个看似活泼享乐的新生代,却有着各自身体和心理上的创伤。GTO鬼冢决不允许自己坐视不管,他以独有的方式再次展开行动……
本片根据藤泽亨的同名漫画改编。。拥有一头青色头发的男主角名字将叫作深井 青(フカイ·アオ,这名字在日语中带有“深青”的意义),是一名13岁少年。青的父亲兰顿·萨斯顿(Renton Thurston、レントン·サーストン)行踪不明,而母亲优莱卡(Eureka、エウレカ)也在10年前被美军带走了。由于继承了母亲的特殊基因,使得他能够看见人眼所不能看到的东西,如粒径为20nm大小的光粒子,红外线、紫外线等等(但在外太空这一特殊生理受到限制)。小时与诊疗所里的老医生深井 敏夫一同生活,现正在Generation Blue(蓝色世代)中。
女主角的名字将是阿拉塔·娜露,同样是13岁,是与青一同成长的青梅竹马。娜露因为童年时的事故而使拥有”ユタ”的力量(犹达,是日本冲绳以占卜为职业的灵媒师的名称)的眼睛醒觉。娜露有能够听懂珊瑚岩心声的特异功能,这是因为珊瑚岩的一部分在她体内成长,从某种程度上来说她和珊瑚岩存在部分融合,但正是因为这样,导致她自小身体虚弱,需要把氧气放入在手上的吸氧器,现与父亲、妹妹及祖母一同生活中。
本作的舞台也设定在冲绳的磐户岛上,当时的磐户岛正进行著自治权回复运动,但在某一天,在岛上出现的珊瑚岩受到了宿敌白细胞G-Monster的攻击,而为了保护磐户岛,男主角青与人型IFO(Intelligent Flying Object)相遇,并与G-Monster战斗的故事就此展开。。外科醫生九十九勝己(三浦貴大)因醫療事故被逐出醫院,走投無路下,透過恩師的介紹來到神酒診所。位於高級住宅區的神酒診所,二樓以上是設備精良的醫療環境,由院長神酒章一郎(安藤政信)率領。醫術精湛的密醫,為需要隱藏病情的大人物們治療。面試那天,勝己目睹章一郎高超的執刀技巧大受震撼,決定要在神酒診所為拯救人命盡最大努力。但事實上,神酒診所暗地裡還提供其他服務,勝己不得不捲進事件當中,也發現自己的醫療事故另有隱情……。