九十年代初期,一场离奇的爆炸让正在从事军事研究的化学工厂化为废墟,三名“军事试验品”从实验室中逃离,下落不明。因为这三名实验品是极度危险的不安定份子,于是中共中央派出了人造人聂玲(杨丽菁 饰)追查他们的下落。
传闻香港屡屡发生抢劫案,犯案的是三名神秘人,和失踪的三个实验品有着极高的相似,于是,聂玲来到了香港,开始她的围剿行动。香港方面,警方派出了尹秋水(万梓良 饰)加入了围剿行动。在一次交锋中,尹秋水为了救名叫小雪(朱茵 饰)的女孩而被聂玲的失忆枪打中,之后,聂玲又被尹秋水误伤。。秘密特工伊森(汤姆•克鲁斯 Tom Cruise 饰)隐藏了真实身份,准备和女友安心生活。这时,他突然接到了上级的电话。超市接头时,同僚向他传达了新的任务命令。任务中,他和黑人老搭档以及两位女将林赛(凯丽•拉塞尔 Keri Russell 饰)和珍(李美琪Maggie Q 饰)并肩作战,在攻入某大厦寻找一个名叫“兔子腿”的证物时,不幸中了埋伏,结果林赛当场阵亡。因为被控失职,汤姆身心背负了巨大的痛苦,在跟上司闹翻之后,他执着地追查着这起事故的起因,却在死者遗留的秘密视频中发现了一个惊天大秘密。为了给死者报仇,让罪魁祸首伏法,汤姆踏上了去往上海寻找关键证据的凶险旅途,结果却落入了犯罪团伙首领欧文(菲利普•塞默•霍夫曼 Philip Seymour Hoffman 饰)的圈套,甚至女友也成了人质……。陆若谷外号六神,是一名神秘的网络安全工程师。他心中一直思念着亡妻,于是潜心研发代码编写了一款智能产品“老伴AI”并决定隐退。而在老同学的强烈邀请下,六神不得不重返职场为程序员后辈们指点江山,没想到在公司里遇到了昔日的逆徒!。