暗恋着老师的十五岁别扭少年岩石友纪顿时大受打击。一路哭着跑回家的友纪一刚进家门,便有一位可爱的小女孩直扑上来将其压倒在身下。还未等他反应过来,小女孩便欢呼着喊其为“老公”,随后三名黑眼镜部队的大叔便将其按倒在地向其出示了由日本总理签署的结婚证书,这下子友纪彻底傻眼了。据黑眼镜部队的大叔们介绍,这名叫rizel的小女孩是最新DNA科技的结晶,是国家的最终武器,所以她的任何要求都可以得到满足。友纪的父母愁眉苦脸地向部队的人抱怨家里的经济状况不好时,三位政府人员非常爽快地表示:只要rizel住进岩石家,所有的费用包括房屋按揭,水电费及日常杂费全部由政府负担……。江户时代末期,在那场惨烈的战争结束后,幕府认输了,天人逐渐渗透到了江户居民的生活当中去,武士道的精神在慢慢衰落,当年骁勇善战的攘夷志士们,也都隐姓埋名得过起了隐居的生活。为了维持父亲的道场,志村新八(坂口大助 配音)和姐姐志村妙(雪野五月 配音)不得不辛苦的工作。为了生 存,在跋扈的天人面前,新八必须忍辱负重。某天,一个自然卷白毛的出现改变了新八的生活,他狠狠教训了欺负新八的天人,却也害得新八丢了唯一的工作。气急败坏的新八追随他的脚步来到了位于小酒吧二楼的“万事屋”,随后他发现,“万事屋”的老板,这个叫做坂田银时(杉田智和 配音)的男人,尽管表面上悠闲懒散,但是却有着一颗“坚决贯彻自己的武士道”的正直的心。银时雇佣了新八,在此之后,对这个时代彻底失望的新八渐渐认识了围绕在银时周围的,善良而美好的人们。
动画片改编自漫画家空知英秋的同名漫画,动画一经播出,立刻引发了“银魂”热潮,开创了“吐槽”与“热血”并存的新的动画类型。。