西暦2199年、地球は宇宙人・ガミラス帝国の侵略を受けていた。ガミラスは冥王星に前線基地を建設し、地球に対して遊星爆弾による無差別攻撃を加えていた。海は蒸発し地球は赤茶けた姿に変貌し、放射能汚染で地上の生物は死滅する。人類は地下都市を建設し、地球防衛軍を結成して抵抗を続けていたが、科学力の差の前になす術もなく、地下にも放射能汚染が進行し、人類の絶滅まであと一年余りと迫っていた。 最後の地球防衛艦隊が、冥王星空域でのガミラス宇宙艦隊との交戦で壊滅し、人類生存の希望は完全に潰えたかに見えた。しかし、この海戦の最中に外宇宙から飛来した一隻の宇宙船が火星に不時着、通信カプセルが回収される。その中にはイスカンダルから、「放射能除去装置・コスモクリーナーDを受け取りに来るように」との救援メッセージと、航海に必要な波動エンジンの設計図が納められていた。極秘裏に宇宙...。21世纪人类开始开发宇宙。但是受到宇宙生物群(通称宇宙怪兽,STMC):一种以恒星作载体繁殖的生物来袭,使人类文明受到重大威胁。为了对抗宇宙怪兽,人类持续开发机器人兵器和宇宙战舰,由地球上的机器人训练学校找出优胜的驾驶员控制。 2015年,在人类史上第一次和宇宙怪兽接触后,故事的女主角高屋法子进入了机器人训练学校接受训练,驾驶对抗宇宙怪兽最强武器:Gunbuster,开始了她守护地球使命的故事。。