瑞恩(Ryan Slater 饰)的爸爸迈克尔(史蒂芬·朗 Stephen Lang 饰)在中国四川大熊猫保护区工作,从小,瑞恩就对爸爸的工作和神秘的熊猫充满了向往和憧憬。暑假来临,这一次,瑞恩终于有机会能够亲临迈克尔的工作场所,这让她感到格外兴奋。 然而,瑞恩刚刚抵达目的地,保护区内便发生了一起偷猎事件,一只熊猫妈妈和它刚出生不久的宝宝遭到了偷猎分子的残忍迫害,顾不上儿子,迈克尔立刻赶往现场,同偷猎者们展开了激烈的斗争。在交火之中,迈克尔受伤了,他不得不将瑞恩和小女孩阿琳(丁一饰)及其爷爷一行人留在原地,乘上直升机暂时先走一步。阿琳的爷爷对偷猎分子们深恶痛绝,他决定依靠自己的力量,找到失落的小熊猫。。在不远的未来,海平面原因不明地急速上升,导致了地表多数都沉入海中。 小时候因为事故而失去一条腿的少年・斑鸠夏生,厌倦了都市的生活,移居到了海边的乡村小镇。曾经身为海洋地质学家的祖母留给他的、就只有船、潜水艇还有债务。 夏生为了取回“失去的未来”,与迷之讨债人凯瑟琳一起,潜海前往据说保存着祖母遗产的海底仓库。 在那里,他遇到了一位沉睡在如同棺材一般装置中不可思议的少女“亚托莉”。她是一位构造精密到与人类别无二致,而又丰富感情的机器人。 从海底被打捞起来的亚托莉如是说到: “我想完成主人留给我的最后的命令。在此之前,我会成为夏生先生的腿!” 在一个逐渐沉入海中的平和小镇,少年和机器人少女的难忘夏日就这么开始了。。