20世纪末,世界各地的天才少年组成了一个名为"炼金之星"的组织,其成员之一的高山我梦作为"XIG"的一员,靠大地给予的红光变身成盖亚·奥特曼后,投入了同CRISIS计算机所预测到的"根源性毁灭招来体"进行的誓死决战中;另一方面,已脱离"炼金之星"的"藤宫博也"坚定地认为:对于地球而言,人类才是真正的癌细胞。他凭着"蓝光"的威力,变身成与"盖亚"相对立的"蓝色奥特曼--阿古茹·奥特曼"。作为日本平成年度奥特曼三作品的压轴戏,盖亚·奥特曼其最大的变化在于"盖亚和阿古茹"这二个敌对、且都为地球人出生的"人类奥特曼"的登场。当然,他俩的战斗场面也属前所未闻。同时,二人的对立观点贯穿前半段,因此前半段贴近于连续剧。佩德拉萨是西班牙的一个偏远小镇,被莫名其妙的恶魔事件所困扰,大多数居民都失去了理智,被关在精神病院里。陷入昏迷的Elena(Megan Montaner饰)躺在马德里医院的病床上,因悔恨而崩溃的Paco(Miguel Ángel Silvestre饰)试图照顾她。随着恐怖的加剧,主人公们必须面对一个神秘的新敌人(Paul Giamatti饰)——一个扭曲到连恶魔都害怕的人。。伊瓦鲁失踪了,他的妹妹急切地想找到他,他的父亲却不以为然。一望无垠的格陵兰土地上藏着不可告人的秘密,一场找寻伊瓦鲁的旅程徐徐展开。。