在上海一条不起眼的小弄堂里,有一家只在深夜营业的小餐馆,老板是一位50岁左右的大叔,他会为每个到访的食客做一份只属于他的食物。生活在弄堂里的忠伯和阿龙都是食堂的常客,每当夜幕降临,这座繁华都市中便有各色孤单灵魂在此相遇。
广告公司的加班三人组便是这般偶然登场,被美食洗去满身疲劳的同时,也邂逅了更多身怀故事的朋友,夜班出租车司机唐宋即是其中之一。唐宋是在接醉酒的音乐人阿信时发现了食堂的存在,从此他就会在清晨带青梅竹马的思思来吃家乡的蛋饼。但是唐宋渴望安逸的生活,思思却有梦想要追寻。在机会繁多的大城市中,两个年轻人的结局会像蛋饼一样圆满吗?
很多人在深夜食堂相遇、相知,也学会成长。小美是一个调香师,她喜欢在食堂诉说自己的喜怒哀乐,尤其是和初恋学长的往事。面对这段遗憾的青春,小美也在食客们的帮助下逐渐释怀。“老牌绅士”的忠伯与菜场的海鲜老板莲婶最终相依为伴。莲婶的儿子开源为人老实憨厚,在食堂偶遇了带女儿来吃糖藕的单亲妈妈明月,爱慕就此在心中萌芽。而“海漂女孩”小雪的出现,也让阿信终于等到了音乐路上的知音……
大叔随着食堂的夜晚一起经历人来人往,满足食客们的味蕾,也见证了各式人生。而无论夜多深、路多远,大叔还会在食堂里继续倾听大家的故事。。郑修宾(柳时元 饰)一直暗恋着青梅竹马的好友金幽兰(金喜善 饰),随着时间的流逝,渐渐长大成熟的幽兰逐渐感受到了郑修宾炙热的感情,然而,幽兰却喜欢上了名为民硕(李昌勋 饰)的男子,两人之间的感情发展的十分顺利,看到幽兰幸福的样子,修宾知趣的选择了离开。
在外出旅行之际,幽兰将自己其实是私生女的事实告诉了民硕,虽然民硕向幽兰承诺不会因为这件事情而抛弃她,但民硕的种种举动均显示出他十分在意幽兰的身份。感到不被认可的幽兰在悲伤之中离开了民硕,重新回到了修宾的身边,然而,就在幽兰想要向修宾索取温暖之际才发现,在修宾的身边,多了另一个女孩。。过著充实大学生活的英文系学生都贤(李大卫饰),偶然因为转学生振浩(金南优饰)而对催眠产生兴趣。都贤在崔教授(孙昞昊饰)的帮助下接受了催眠治疗,但在催眠体验后,他却开始看见充满疑惑的记忆幻影,朋友们也一个接一个开始深受幻影折磨,而遭遇奇怪的事件。崔教授对他们催眠的目的究竟为何?。