《神秘失踪的船》讲述了解放战争时期,宋庆龄通过海外华侨将一大批军需药品秘密运往国内,然而船行至东海突然失踪。我党中央立即派人查找,国民党也出动海、陆、空军前往搜杏。原来药品船被舟山群岛海盗司令方大雨劫持。海盗们不知箱中是何物,方大雨欲请恋人海曼的父亲弄清这批货。当他赶到鱼乡小镇,发现海曼的父亲惨遭地方女匪首王八妹的毒手致伤,海曼也被绑架。方大雨将自己儿子托付法华寺方丈,只身回到岛屿。我党特派员鲁平化装成郎中,走街串巷打昕失踪船只的下落.不幸落入匪手。侦察员小郭巧妙地救出鲁半和海曼一同找方大雨。狡诈的王八妹派人暗中跟踪。万大雨感谢鲁平他们救了海曼,却始终不提归还药品的事。尾随而来的王八妹与国民党官员朱天龙对方大雨软硬兼施,欲夺药品,骑虎难下的方大雨只好趁黑夜率众离岛。老谋深算的朱天龙料定方大雨会携子而逃,于是在法华寺设下伏兵将方大雨擒获,欲将他慢慢沉入海底。。500英尺的海面之下,美国海军弹道导弹核潜艇科罗拉多号接到从加密频道传来的信息:命令他们向巴基斯坦发射核导弹。这个频道通常只在美国本土遭到核打击时才会使用。指挥官Marcus上校(安德鲁·布劳尔 Andre Braugher 饰)要求确认命令,白宫突然下令解除他的职务。副指挥官Sam(斯科特·斯比德曼 Scott Speedman 饰)接管了这艘潜艇,但他一样拒绝在未得到确认命令的情况下发射核弹,美国政府立即宣布科罗拉多号全体船员已经叛变,下令美军舰队对其实施打击。尽管他们逃过一劫,但科罗拉多号遭受重创,不得不逃向太平洋腹地。指挥官驾驶这艘载有24枚核弹头的战争机器躲过美国军方的追捕逃到太平洋上的圣玛丽娜岛,夺取了北约组织在那里设立的监听站,宣布成立世界上最小的有核国家。消息传开之后举世震惊,美国国内的政治家们如坐针毡,发誓要采取一切手段消灭这个可怕的威胁......。由于被监视者告知了自己会在危机当中消失,闪电侠巴里·艾伦(格兰特·古斯汀饰)已经做好了牺牲的准备,便开始着手与自己的家人和同伴们进行告别,并发誓在此之前要拯救尽可能多的性命。但身患黄体噬血细胞综合征的拉齐姆·罗素(森德希·拉玛莫西饰)在意识到星辰实验室的血清已经无法治愈病入膏肓的自己时,选择了其他方式来让自己继续存活下去,甚至为此不惜夺取他人的生命,使他开始走火入魔。 与此同时,巴里开始逐渐意识到自己的妻子艾瑞丝(坎迪斯·帕顿饰)变得越来越不像她了.......。