当成千上万的鱼死在智利南部一条被污染的河流时,一个本应早已去世的女人马格达莱纳出现在了这些尸体中。马格达莱纳遇到了她鳏居的丈夫,使他陷入深深地震惊之中,这也促使他们的女儿塞西莉亚回到了故土。马格达莱纳的出现和她对环境的影响在家人之中激起了好奇和恐惧。随着往事渐渐清晰,母女俩迎来了改变未来的好机会。。在一个风景如画的英国乡村,自然学家查尔斯·达尔文与妻女一起过着恬静的生活。他十岁的大女儿安妮对世界充满好奇,达尔文便教予她很多自然和科学知识,其中还包括他的进化论,然而在世人都相信上帝乃造物主的当时,女儿口中的进化论无疑是危险的,以至于令她被家庭教师体罚,就连达尔文深爱的妻子艾玛也无法认同他的观念和研究。更令达尔文受创的是,不久后,小安妮因生病早夭,唯一一个支持他完成学说的力量之源也黯淡了,整理《物种起源》手稿的工作变得犹如逆行荆棘,举步维艰……
本片改编自达尔文第三代玄孙兰德尔·凯恩斯(Randal Keynes)的传记小说《安妮的盒子》。。