1942年,旅顺港码头上,一批中国劳工被侵华日军强行押上轮船运往日本。入夜,渔民海牛趁乱跳入大海,潜回村中,却见亲人及乡亲惨遭杀害。他强忍悲愤,携小狗欢欢来到一荒岛,开始野人般的生活。一日,海牛在海边救回姑娘山田叶子。当他得知叶子是日本人时,欲用渔叉结束其性命。但在善良人性的驱使下,他仍继续为其熬药治伤,悉心照料。后来海牛从偶然上岛的姜二叔口中得知叶子是日军随军女子,心中又生厌恶,欲将其送返旅顺口。叶子苦苦哀求,并诉说了自己的不幸身世。海牛从中感受到这场侵略战争同样给日本人民带来深重灾难。共同的命运,使两颗年轻的心紧紧连在一起。三年后,他们生下一子,取名小牛牛,荒岛上从此充满欢声笑语。不料,一群溃败的敌军来到小岛,他们杀害了海牛,奸杀了叶子,又将他们辛勤建立的家园焚烧殆尽,只留下小牛牛凄惨的哭喊声在荒岛上空回荡。。在闹市区的后巷中,平凡高中生藤岛鸣海(松冈祯丞 配音)目睹了一桩突发事件。不日,他被同班同学彩夏带去了她打工的“花丸拉面店”,在这里,他居然又遇到了当天那三个“可疑人物”——柏青哥高手阿哲、“军事宅男”少校以及相貌俊美的宏哥,三人自称为“尼特族侦探”。就在鸣海一头雾水时,他阴错阳差地来到了“NEET侦探事务所”,遇上了一名奇怪的少女爱丽丝(小仓唯 配音)。爱丽丝看似是一个足不出户的家里蹲,事实上她是个拥有高超技术的网络黑客,她利用自己的能力接受委托,成为尼特族侦探。
因缘际遇下,鸣海当上了爱丽丝的助手,帮助调查事件。这个没什么存在感的平凡高中生,在尼特族侦探团中能起到作用吗?曾经不希望和别人有过多来往的鸣海,会和爱丽丝以及尼特族的大家产生什么样的羁绊?。