西元1999年,一顆不明的巨大「流星」墜落在地球上。之後調查證實這其實是一艘外星人的宇宙船,之後世界的某些強國為了將其修復並彌補墜落時對地球環境所造成的破壞(還得掩蓋掉這個外星船墜落的事實),而組成了統合政府。並由地球統合軍將其改造成為全長1200公尺的超大型主力戰艦,命名為「馬克羅斯」(MACROSS,德文「大宇宙」之意)。其間人類卻也歷經統合派與反統合派國家陣營的分裂,在綿延的爭戰中馬克羅斯的改修則仍然持續著。直到10年後,在馬克羅斯舉行正式起用下水典禮的當天,在月球軌道附近突然發現有大規模的時空跳躍反應。而此時馬客羅斯艦上的主炮竟自動發射,並擊中在月球出現的外星艦隊觀測艦!事已至如此頓時成了趕鴨子上架,不把對方惹毛才是怪事……於是統合軍只好展開接戰,並讓馬克羅斯升空啟航,以轉移敵方注意。青年一條輝陰錯陽差的坐上了統合軍的戰機捲入戰鬥,並救起了一位名叫林明美的少女,且與艦上女軍官早賴未沙的不吵不相識……被稱為「第一次宇宙大戰」的這場人類對異星人的戰爭就此揭開了序幕。而圍繞在輝、明美與未沙之間的感情糾葛,卻也開始介入了戰事的發展之中,甚而成為主導後來歷史走向的契機……。盐田真理子(安藤樱饰)是一个单纯善良的十七岁女子高中生,就读于当地有名的女高中,在合唱团里担任独唱的重要位置。真理子一直渴望能够成为一名歌剧演唱家,并且,她一直在为了实现理想而不断的努力着。一天,真理子邂逅了一位名叫赵圣文(石田卓也饰)的男子,赵圣文不小心弄丢了真理子的乐谱,为了表示歉意,赵圣文同意每天护送真理子回家。 就这样,在宁静的街道上,每天定时定点会出现真理子和赵圣文的身影,日复一日,一种奇妙的感情在两个年轻人之间产生了。虽然真理子并不知道赵圣文究竟是什么人,有着怎样的过去,但这并不能阻止两颗心日渐靠近。。