故事发生在2029年,此时X战警早已解散。作为少数幸存的变种人之一,金刚狼罗根与卡利班共同照料着年迈的X教授(查尔斯·泽维尔)。由于衰老,X教授失去了对自己超能力的控制,如果不用药物抑制,他的力量会失控,造成全球性的灾难。同时,随着时间推移,金刚狼的自愈能力也在减弱,体能和力量远不如从前。
一天,一位陌生女子找到了金刚狼,请求他护送一名叫劳拉的女孩前往加拿大边境的“伊甸园”。罗根后来发现,劳拉是通过植入自己的基因培养出来的人造变种人。而在所谓的“伊甸园”,有一群与劳拉有着相似遭遇的孩子。邪恶的唐纳德紧追不舍,他的目标就是彻底消灭这些人造变种人。。在某间加油站的便利商店,每隔一段时间就会发生凶杀案,这是随机事件?还是神秘的巧合?在又一次凶杀案发生之后,一位天才数学家终于发现反转命运的秘密,竟然藏在一串数字里。他依循神秘的数字线索发掘真相,试图挽救下一个受害者,一个十岁小男孩的生命,但随着警告信的日期接近,他还有机会拯救人命吗?。