知名建筑设计师森谷帝二这日邀请新一参加在他府上举办的茶会,柯南只得电话拜托小兰。柯南、小兰及毛利小五郎三人未入森府,已被绝对对称的宏伟建筑吸引。衣香鬓影的茶会上,森谷帝二令人诧异地大声攻击年轻设计师,讲建筑的美学准则要被他们破坏殆尽。柯南在规定时间内将他出给众宾客的难题破解,被获准和小兰一起参观陈有他设计图的展览馆,交谈中,他感慨30多岁初成名时的作品不够对称称不上完美,并从小兰口中打探到她要与新一在米花大楼约会为新一庆生的诸多细节。
不久,柯南连接数通向新一挑战的电话,对方均告知他已在某地放置会在某时爆炸的炸弹,柯南将危机一一化解后,开始与警方、毛利一起分析到底是何人所为。电视报道其中最为轰动的爆炸案时,柯南由画面联想到所有炸弹放置的地点附近均有森谷帝二自认不完美的作品,心中一惊。众人拜访森谷帝二时,柯南暗中将他的宅邸查看,找出凶犯正是他的证据,原来他是狂热的完美主义者,想亲手毁掉年轻时因妥协设计出的不绝对对称作品,并借机报复没令他的宏伟设计夙愿在西多摩市达成的新一。被抓一刻,森谷帝二的冷笑令柯南醒悟:米花大楼亦是他不完美的作品,小兰正在那里等新一赴约。。本作围绕着高中生的日常生活,讲述了在“炼金术”盛行的时代中,青年人们为了守护正义、追逐梦想,而勇敢对抗邪恶势力的故事。
炼金术本来指的是尝试从普通金属中提炼黄金的技术,随着科技发展,炼金术士们尝试将人类的肉体和精神作为对象,加以熔炼。汇集这种炼金术的精华而创造出来的,就是完全的人工生命体,101只“凯米”。
可是原本应该被封印在“凯米卡”里的凯米突然被释放了,探求梦想的高中生一之濑宝太郎偶然目击了这一过程,从此被卷入了这场风波中。他与凯米相遇,结识神秘的女同学九堂凛音,还被托付了变身腰带。
一之濑宝太郎决心保护凯米不被邪恶势力利用,并立志要与凯米成为同伴。于是他和朋友们一起变身为假面骑士,开始了追逐梦想的旅途,一群青涩懵懂的高中生也逐渐成长。。