《内裤队长》讲述了两个早熟的四年级小学生——乔治·比尔德(George Beard)和哈罗德·哈钦斯(Harold Hutchins)利用催眠术把他们的讨厌校长本尼·克鲁普(Benny Krupp)先生变成了穿着内裤的超人——“内裤队长”!这个内裤超人对孩子们很友善,总是能帮他们摆脱各种麻烦,但一旦恢复清醒,就会忘了自己作为“内裤队长”所做过的事情。。某座平凡小镇,彪悍恐武的警探约翰·伊利亚特(维尼·琼斯 Vinnie Jones 饰)和美丽善良的女儿海瑟(Emily Tennant 饰)生活在一起。某天一名酷酷的男孩来到海瑟的学校,他叫罗比·穆勒(杰克·克罗克 Jake Croker 饰),五年前曾和海瑟有过一面之缘,并且卷入了一场神秘恐怖的死亡时间。罗比似乎对海瑟颇有好感,但却因此惹恼追求这个女孩的格雷戈(Aren Buchholz 饰)。在一次争执中,五年前的恐怖一幕再度上演,格雷戈在没有任何人碰触他的情况下突然倒地,遭受重创。
不久后格雷戈伤愈出院,却死性不改,对罗比欲行不轨,最终在野外死于一场离奇的事故。约翰受命调查此案,种种疑点全部指向了神秘而阴森的罗比……。幸运伦因意外受伤被送到医院,医生救回他的性命,但他伤了尾龙骨,下半身暂时瘫痪。阿汉告诉Stone他回港参加一个国际射击比賽。他满口正义,不斷助人,更输血给幸动伦,並鼓勵幸动伦要战胜病魔。此时警方在一宗国际大集团洗黑钱大案中,要保证三名污点证人。第一名证人被杀,种种跡象顯示此乃职业杀手所为,接著第二名证人又遇害。Stone开始怀疑阿汉。阿汉感觉到Stone怀疑自己,便表示要回美国。此时,警方決定要飞虎保证第三名证人。Stone亲自出马,和证人交换衣服,守候杀手出现……。