曾经有一场被称作“厄祭战”的大型战争。那场战争终结后过了大约300年。
地球圈失去了至今为止的统治机构,在新的支配体系下,新世界被构筑起来。一时的和平到来,与此同时,远离地球的火星圈燃起了新战争的火种。
主人公——少年三日月·奥古斯,从所属的民间警备公司克律塞安保公司(下称CGS)那里,接受了打算让在地球势力统治下的火星都市独立的少女库德莉亚·蓝那·伯恩斯坦的护卫任务。但,CGS受到摘取反叛之芽的武力组织加拉尔霍恩的袭击,于是在把三日月这些孩子当做诱饵后撤退了。少年们的领袖,奥尔加·伊兹卡认为这是个机会,并决定对虐待自己的大人们掀起反旗。被奥尔加托付击退加拉尔霍恩的三日月,利用被当做CGS动力炉来使用的“厄祭战”时代的机动战士——高达·巴巴托斯,向敌军发起挑战。。男主角阿心是一位擅长超级英雄题材的漫画家,他拥有一个幸福平静的家庭。有一天,惊慌地得知自己只剩下两周的生命。绝望中,阿心莽撞地加入由马教授主持的换头手术。他与一个死在森林的神秘人交换头部,不仅恢复健康,而且体力惊人,成为超级英雄。然而,他对美丽的女医生阿惠产生奇妙的感觉。阿心也陷入了由大佬为首的黑帮麻烦……。