美国深海勘查潜艇“赛任1号”在一次例行任务中失事,当局命令潜艇设计师(主人公)组织一支由军人和各类科学家构成的小队,乘坐另一艘同型潜艇“赛任2号”下海救援“赛任1号”,成员里面有两个女性,其中一个是潜艇设计师的前妻。 搜索的线索是“赛任1号”上面的一只“黑匣子”。救援队据此潜航到一个非常隐蔽的海沟。途中这艘黄色潜艇被一个巨大的白色不明物体包裹住,艇长用电击法驱走这个怪物。三名潜水员出艇勘查,发现这里的海藻发生过变异,大得出奇。一名潜水员遭隐藏在海藻林间的异形生物突袭而亡,另两名生还者采集了一些变异的海藻后返回潜艇。 潜艇为了躲避变异生物的袭击,进入了海沟内部探险,结果发现海沟最底部有一个巨大空洞,潜艇浮出水面,艇员们穿着如同宇航服的特种防护衣进入这个幽深的洞穴,发现内部竟然有人工开凿的痕迹,里面到处都是变异生物,有的类似巨型蜜蜂,有的类似海蛇和恐龙的...。王公世铎对玝爷恨之入骨,其子闹市奔马,拖死行人。奕玝出头,导致其子死在狱中。适逢宫中选秀,在慈禧的干涉下,光绪娶其侄女为皇后。大婚将至,内宫却突着大火,烧毁太和门。世铎将此事责任全推给奕玝爷,并诬其偷走宫中文房四宝;幸好光绪为其开脱。大婚之际,奕玝爷找来工匠糊了个纸太和门,算蒙混过关;可文房四宝就没法交差,玝爷只好以宅充抵。
奕玝爷趁此搬往南城小院,这样离心仪艺人朱帘秀近了。在南城,玝爷先与地痞花蝴蝶结仇,后又教王五耍大刀。通过小姨淑美,玝爷认识了具有维新思想的文海澄,推荐给光绪,深为赏识并委以重任。在淑美的捉弄下,玝爷竟闹出了与朱帘秀“私奔未遂”的闹剧。碍于面子,玝爷只身到通州,却掉入了世铎设下的陷阱中,被诬成劫镖之人,拉赴刑场问斩。最终玝爷无罪释放,海澄因此丢了官职。急于报国的奕玝爷目睹慈禧凌驾于光绪之上,发誓要助皇帝亲政。光绪命玝爷送字画给南方的康梁,虽有世铎破坏,终不辱使命。玝爷终于查到朱帘秀父亲之死是因他知慈禧并非旗人身份,玝爷以此逼慈禧支持光绪亲政,慈禧只好答应。维新革命党进京,开始变法维新;最终慈禧发动了政变,变法失败。海澄却因救玝爷将一腔热血撒向了大地。。