自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。。王妃谢云曦遭荣安王萧宸与傅烟烟陷害致死,重生后她决心复仇。利用灵犀阁主裴玄麟的帮助,在婚宴等场合揭露傅烟烟恶行,使其失宠。又借波斯使臣事件让萧宸被削权,还巧妙应对王府阴谋。最终发现裴玄麟就是儿时恩人及皇帝,萧宸伏法,谢云曦走向新人生。。