少年张君宝(万梓良 饰)原来是少林寺的打杂僧人,虽然一直向往练武,然而每天接触到的都是些洗衣、做饭的杂活,令君宝一直郁郁不得志。一次偶然,君宝因触犯少林寺寺规被赶出了少林,君宝发誓一定要练好武功、出人头地。离开少林后,君宝一次偶然机会遇到了奇人陶石麟,在他死缠烂打之下,石麟终于同意收他为徒,从此,君宝就住在石麟家跟他学习武艺。
石麟的养女彩衣(米雪 饰)见君宝老实忠厚、英俊潇洒,对他芳心暗许,处处帮助,而石麟表面对君宝十分刻薄,彩衣处处护着君宝,爱情在两人之间慢慢滋长。石麟吩咐君宝炼成用手将抛起的豆腐接住的本领,然而,豆腐实在太柔软了,每次君宝都把它捏碎。君宝一直苦练而不得法,甚至想用诡计瞒骗石麟。随后,石麟又安排他去弹棉花。君宝在弹棉花时看着飞舞的棉絮,终于领悟出用手接豆腐的诀窍。之后在挚友空明和尚(曹达华 饰)的点化下、君宝终于悟出“以柔克刚、后发制人”的道理。
这时,小王爷爱上了彩衣,而彩衣却与君宝私定终身,故因爱成恨;同时,郡主美妮(米雪 饰)亦因爱上了君宝无奈他已有了彩衣,也因爱成恨。小王爷和美妮开始了共同联手对付君宝和彩衣。。燕山君即位為帝,一心要追封被先王廢黜賜死的母后尹妃,但受百官阻撓而作罷。無法恢復尹妃的身份,讓燕山君感到日夜被母親的冤魂纏繞,因而變得異常暴躁,荒廢政事。 申相玉對於《燕山君》被西方評為「韓國的《哈姆雷特》」,顯得不以為然,而且對於當年為了趕及新年檔期上映,只能用兩個月倉促拍竣一部歷史鉅片,極為不滿。連同翌年的續集《燕山暴君》(1962),他曾揚言希望把兩部影片的菲林底片都燒毀。儘管如此,《燕山君》在當年還是叫好叫座,獲頒第一屆大鐘獎(1962)的最佳電影。。