在异次元世界的北玄星上,存在一个利用人类训练的战斗灵物进行斗灵的族群,邪派血盟妄图依靠拥有强大力量的魔晶称霸拳台而对付斗灵族群;斗灵师庄峰在重创之下失去斗志,女儿庄妙为了帮助父亲重拾信心并对抗血盟,选中了资质极差却潜力无限的异魃石头加以训练,石头的出现不但令庄峰重新燃起斗志,在拳台上拔得头筹,更成为庄峰与庄妙之间的情感纽带,终使父女俩冰释前嫌。此版《源氏物语 千年之谜》由鹤桥康夫执导,不仅使用CG,还加入动作场面和科幻效果,制作费用高达十亿多日元(折合人民币7千8百多万),于2011年12月10日在日本全国公映。
影片把原著作者紫式部(中谷美纪 饰)身处的平安时期与光源氏(生田斗真 饰)所在天下相交错,两条线 索并行。一个空间中紫式部受藤原道长(东山纪之 饰)任命开始创作《源氏物语》,并与藤原道长发生了爱情牵绊。另一个空间是紫式部创作出的光源氏与藤壶女御(真木阳子 饰)、六条御息所(田中丽奈 饰)、夕颜(芦名星 饰)等众多女性的爱情纠葛。在关闭的创作进程中,紫式部现出了灵魂出窍的状态,与笔下对光源氏陷入苦恋而化为生灵的六条御息所的灵魂重叠。阴阳师安倍晴明(洼冢洋介 饰)发现了这个情况,开始追踪生灵……。